雖然苦菊是營養價值很高，食用功效不錯的美味佳肴，但是吃苦菊要注意一些禁忌問題 。任何正確食用，才能將它的營養價值更好的發揮，否則不但吃了沒營養，反而會給人體帶有不良影響也說不定。

苦菊屬于涼性的食物，所以不適合脾胃虛弱的人吃，有腹瀉情況、血粘度高的人的也不適合食用，否則會加重不適癥或者加重狀病情。

另外，有幾種食物是不適宜與苦菊一起吃的，包括：蔥、蜂蜜和白蝦。一起吃的話，會影響到食療效果和營養素的吸收。